2.电算化基础管理工作十分薄弱
会计电算化虽然在很大程度上减轻会计人员的工作量，但同时也增加了操作人员、系统维护人员等岗位，带来了许多新的要求，提出了新的问题。而目前，我国建立在手工操作条件下的会计基础工作的管理还存在着很多不足，一些中小企业内部控制也不是十分完善。具体表现为没有严格的保密制度，电算化操作人员与系统维护人员没有设定权限限制措施，导致会计档案管理不严，造成企业财务信息泄密等情况出现。实施会计电算化，就需要建立与之相配套的一系列内部控制制度加以约束，才能充分发挥电算化的优势。目前，不少单位没有严密的管理制度或有章不循，使得会计电算化不能正常健康运转。由于基础工作薄弱，建立在此基础上的电算化管理也就出现了一些问题，导致手工与计算机运行时间过长，增加了会计人员的工作量。
3.会计电算化工作是法规的盲区
按照《会计法》规定,财政部制定并发布了《会计电算化管理办法》、《会计核算软件基本功能规范》、《会计电算化工作规范》、《会计基础工作规范》和《会计档案管理办法》等一系列会计制度。对单位使用会计核算软件、软件生成的会计资料、采用电子计算机替代手工记账、电算化会计档案保管等会计电算化工作作出了具体规范。但不少已经实行会计电算化的单位，无论是单位的领导，还是单位财务部门的财会人员尚不知道上面这些专门针对会计电算化的规章。甚至有的地方的经济管理部门也不知道这些规章的存在，会计电算化的实行基本上是会计软件公司安装，帮助会计人员会操作就算了。因此，有时在实际操作中已经违规了,但操作者不清楚，单位的领导也不知道，同时也没有相应的部门去纠正，更谈不上有部门监督管理了。
4.数据保密性、安全性差
很多时候，财务上的数据，是企业的绝对秘密，在很大程度上关系着企业的生存与发展，但几乎所有的软件系统都在为完善会计功能和适应财务制度大伤脑筋，却没有几家软件认真研究过数据的保密问题。而有些软件所谓的加密，也无非是对软件本身的加密，防止盗版,不能真正起到数据的保密作用，安全性上，更是难如人意，系统一旦瘫痪，或者受病毒侵袭,或者突然断电，很难恢复原来的数据。
5.会计电算化内控制度不完善
在手工会计核算时，一项经济业务的每个环节要经过具有相应权限人员的审批，如果把关严格，核算中的一些错误能被及时发现，实行会计电算化后，业务的处理都以电脑为载体，某些人员往往既从事数据的输入，又负责数据的输出，许多审批环节被省缺了从而加大了出现错误和舞弊的风险。此外，由于电脑中原始数据是由人工事先进行审核和输入计算机的，但实行会计电算化后放松了人工审核审批这项基础工作，致使一些原始数据输入中发生错误，出现错误的数据而不能及时纠正。实行会计电算化后，作为财务人员应加强数据的备份，确保数据的安全和完整。但会计人员对数据备份的重要性往往认识不够，导致一旦电脑出现故障，部分财务数据就被丢失。还有的对备份的数据盘没有定期检查，发生问题没有相应的补救措施，给自身会计核算工作带来不必要的损失。
6.会计人员计算机业务素质偏低
目前，不少单位的电算化人员是由过去的会计、出纳等经过短期培训而来，他们在使用微机处理业务的过程中往往很多是除了开机使用财务软件之外，对微机的软硬件知识了解甚少，一旦微机出现故障或与平常见到的界面不同时，就束手无策，即使厂家在安装会计软件时都作了系统的培训，但一些从未接触过计算机的会计人员入门还是很慢，而且在上机时经常出现误操作，一旦出错，可能就会使自己很长时间的工作成果付诸东流，使系统数据丢失，严重的导致系统崩溃。
7.软件开发难以满足新会计制度要求
计算机技术的迅猛发展给会计软件带来一个又一个的黄金时期。但是，大多数软件开发商只注重会计软件、使用平台、开发工具、使用环境等计算机技术方面的提高，而忽略会计功能的拓展。比如，对固定资产折旧方法的处理与选择、存在大量外币业务的企业里，对外币汇率的选择。新会计制度规定，这些方法一旦选定，不能随意更改，如果要更改，必须上报上级主管部门批准，同时在会计报表附注中加以说明。而现行会计软件中未设置本年度内不允许改动的控制功能，这就使得一些用户随意修改原先所确定的方法，甚至有的用户同软件开发商一起进行反结账、反记账等违反会计制度的活动。
三、加强和改进会计电算化的思路
1.要提高对会计电算化的认识
要认识到建立完整的会计信息系统对企业的重要性，使现有的会计信息能及时、有效地为企业决策及管理服务。同时，在软件更新及硬件投入等方面要加大支持力度，能利用信息技术优势提高企业运作效率。这种认识对会计电算化的发展十分有利。我们必须认识到会计电算化不仅改变了会计核算方式、数据储存形式、数据处理程序和方法，扩大了会计数据领域，提高了会计信息质量,而且改变了会计内部控制的方法，因而推动了会计理论与会计技术的进一步发展完善，促进了会计管理制度的改革，是整个会计理论研究与会计实务的一次根本性变革。从表面上来看,会计电算化只不过是将电子计算机应用于会计核算工作中，减轻会计人员的劳动强度，提高会计核算的速度和精度,以计算机替代人工记账。而实际上，会计电算化决不仅仅是核算工具和核算方法的改进，而且必然会引起会计工作组织和人员分工的改变，促进会计人员素质和知识结构，会计工作效率和质量的全面提高，节省会计人员的时间和精力，转变会计工作职能，推动会计理论和会计技术的进步，提高整个会计工作水平，大幅度增加企业的经济效益，使会计理论和实务的方方面面都将发生前所未有的深刻变化。
2.加强对计算机系统的硬件和软件的管理
随着计算机在会计工作中的应用，管理部门对由计算机处理的各种数据、报表等会计信息的依赖程度越来越大，这些会计信息的产生只有在严格的控制下，才能预防或减少使用计算机犯罪的可能性，保证其可靠性和准确性。会计部门必须针对计算机系统的特点，制定对用于会计工作的计算机硬件和软件有关的操作管理制度和系统维护管理制度。实行会计电算化后，会计人员必须操作计算机才能进行会计核算工作，如果操作不正确可能造成系统内数据的破坏或丢失，影响系统的正常运行。因此为了保证系统的正常运行，完成预定任务，保证系统内各种资源信息的安全与完整，应制定严密的计算机操作管理制度，包括会计软件的操作工作内容和权限，操作密码的严格管理，预防会计数据未经审核而登入机内账簿，保存上机操作记录，计算机病毒的防范措施等制度。与此同时加强日常使用管理，防止各种非法人员上机操作，为计算机设备创造一个良好的运行环境，保护机内程序和数据的安全。系统维护管理包括硬件维护与软件维护两部分。硬件维护主要是在系统运行过程中出现硬件故障时，及时进行故障分析，并作检查记录，在设备更新、扩充、修复后,由系统维护人员安装和调试。建议在硬件维护工作中，一般故障由本单位电算化维护人员负责，较大的故障应及时与硬件生产或销售商联系解决。系统软件维护主要是检查系统文件的完整性以及系统文件是否被非法删除和修改，以保证系统软件的正常运行。软件维护主要包括正确性维护、适应性维护、
完善性维护三种。正确性维护是指诊断和改正错误的过程；适应性维护是指单位的会计工作发生变化时，为适应新情况而进行的修改活动；完善性维护是为了改善已有功能的需要而进行的软件修改活动。
3.实行严格的授权控制
为了防止系统非法介入、篡改或发生舞弊行为，必须实行严格的授权控制。利用财务软件权限控制功能，通过对不同人员权限的分配、设置密码等手段对上机操作和动用系统资源加以控制。由于计算机软件开发人员对软件的结构和设计相当熟悉，他们有能力也有机会进行非正常的数据修改,因此，必须对其操作权限进行严格的限制，不允许软件开发人员有会计记账、修改、出纳等权限。为此，主管会计应熟悉财务软件，严格掌握操作人员的权限确定权，从而达到保证操作权限控制的有效性，进而保证会计信息和会计资料的真实性、合法性。
