因中小企业大多数为私人投资，资金有限在初创期间组成人员较少，一般会以简单的方式进行运作管理，这样的结构在创业初期会产生较高的效率，但是一旦初具规模时，简单化的组织往往会出现分工不到位，分化不细，导致管理上出现很多问题；发达国家相比还存在较大差距;其次我们要看到我国的高科技产业发展的状况不容乐观。另外根据统计,我国的发明专利是韩国的1/4,是日本和美国的1/30。我国大多数企业的规模、技术基础和力量都相对薄弱,难以进行技术难度大、投人大、周期长、市场风险大的原始创新。 而且目前我国大多数的企业更看重有利可图的革新,大多数企业高层对存在较大风险的科技创较为敏感。 因此,我国多年来一直强调的科技自主创新,在很大程度上都是停留在口号上,而没有落实到思想和行动上。
4.中小企业融资难
由于中小企业规模普遍较小，偿还债务的能力不足，使得银行对这些企业望而却步，另外，管理素质较差财务管理混乱，会计制度不健全也造成中小企业融资难得另外一个重要原因，以上原因导致我国中小企业融资渠道狭窄，特别是不可能获得与大型企业一样的银行贷款条件，融资难问题一直是限制非公有制中小企业发展的致命的因素之一。
5.中小企业核心员工流失
中小企业的核心员工是指熟练掌握切核心技术,精通企业的核心业务，掌管企业的核心资源，能帮助企业完成经营目标并保持不断提升企业核心竞争力的员工。核心员工具备组成企业核心竞争力的核心技能，且均在企业的重要职位上担任要职。一般来说，如果中小企业能将人才流动的比率控制在15%以内，那么这对企业来说可以很好的改变企业一成不变的管理运行模式，为企业带来新的血液，使得员工有危机感。但是近些年来，时代步伐较快的发展，员工思想转变使得离职较为频繁，使得企业得不到很好的发展
三、改善中小企业良好发展的思考和建议
1.建立中小企业的社会化服务体系，为中小企业提供全方位服务
我国在李克强总理提出的“全民创业，万众创新”的前提下中小企业的量出现激增，如不对中小企业创造良好的服务环境，中小企业很难得到长久的发展。建议成立促进中小企业发展机构，在国外，大部分国家都设有专门的机构扶持中小企业厅。美国有设立中小企业特别委员会，英国设有地方中小企业协议会，我国目前应该设立促进中小企业发展管理机构，为中小企业提供信息、咨询、协调等全方面的服务工作。
2.企业发展规模化、树立自己的品牌
由于产业领域比较集中,各产业集群所生产的一些主要产品,一般都在全国甚至世界市场上具有较强的竞争力,占有较高的市场份额,享有相当的知名度。如美国好莱坞制造的影片、硅谷生产的IT产品,印度班加罗尔设计的软件,我国温州生产的打火机等,都在世界上具有较好的声誉。随着产业集群的成功,集群所依托的产业和产品不断走向世界,自然就形成了一种世界性的区域品牌。区位品牌与单个企业品牌相比,更形象、直接,是众多企业品牌精华的浓缩和提炼,更具有广泛的、持续的品牌效应,它是一种珍贵的无形资产。这种区域品牌是由企业共同的生产区位产生的,一旦形成之后,就可以为区内的所有企业所享受因此,区域品牌同样具有外部效应。这种区域品牌效应,不仅有利于企业对外交往,开拓国内外市场,确定合适的销售价格,也有利于提升整个区域的形象,为招商引资和未来发展创造有利条件。